Natury Chakry są wymagane, aby pojąć trudniejsze Jutsu żywiołowe. Pierwszą naturę Chakry otrzymuje się na poziomie Genina, drugą na poziomie Chunina, trzecią na poziomie Sannina. Natura danego żywiołu wzmacnia Jutsu tego żywiołu o 25%(1/4) i zmniejsza jego koszt o 1/4. Każda z natur ma 3 poziomy: Wstępny, Zaawansowany, Ostateczny. Opiszę tutaj wszystkie z nich:
Wstępny:
Cena jutsu spada o 1/4, a jego siła wzrasta o 1/4. Gdy posiada się 2 natury można te Jutsu łączyć.

Zaawansowany:
Można stworzyć własną technikę związaną z tym żywiołem. Siła jutsu wzrasta o 1/4.

Ostateczny:
Jest się mistrzem w wykonywaniu danych technik i nawet najsłabsze techniki danego żywiołu potrafią być zabójcze.
(np. -Hahahahahha!!! Co mi ta maciuśka kuleczka ognia może zrobić?! Ej zaraz zaraz... Czemu cały las się pali?) Coś w tym stylu, no może bez przesady...